Diary/2008-12-25

バッテリの充電

以前使っていた大容量バッテリをスペアとして持ち運ぶために
バッテリの充電について考えてみた．
X60のバッテリは，4直2パラなので，
1セルあたり低電圧4.2V，定電流1Cで充電するとかんがえれば
16.8V，2Cな電源を用意すればいいことになる．

電源は，X60のACアダプタと同じもので(追加で購入しても5k円くらい)で，
あと，たとえば，こんなキットを使うと簡単にできるかなあ．
http://akizukidenshi.com/catalog/items2.php?q=%22K-02190%22&s=score&p=1&r=1&page=

年賀状の印刷

とりあえず60枚．
ほとんど使っていなかったカラーインクを
警告マークが点灯するくらいまでに消費．
ヨドバシで，換えのインクを購入．
リサイクル品で，2個で約1900円．

Multicore partitioning is a threads and comms problem

http://www.eetimes.com/showArticle.jhtml;jsessionid=K5DRN03DLJGBSQSNDLPSKHSCJUNN2JVN?articleID=211201707

スレッドレベル並列性を活かす科学技術計算用FPGAシステムの提案

[論文読み]

IPSJ-ARC08180015
2008-ARC-180
Vol.2008 No.101

FPGA上にモジュラな構造のハードウェアの組み合わせで計算システムを構築する．確率モデル生化学シミュレーションを題材に評価．実装は，First Reaction Method(FRM)．

確率モデル生化学シミュレーション

Stochastic Biochemical Simulation Algorithm(SSA)
Exact Stochastic Simulation of Coupled Chemical Reactions(http://www.dna.caltech.edu/courses/cs191/paperscs191/gillespie2.pdf)

• ソフトウェアによる高速実行アルゴリズム
  • Stochastic Simulation of Chemical Kinetics(http://arjournals.annualreviews.org/doi/abs/10.1146/annurev.physchem.58.032806.104637)
  • Efficient Exact Stochastic Simulation of Chemical Systems with Many Species and Many Channels(http://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/jp993732q)
• GPUによる高速実行
  • Efficient Parallelization of Stochastic Simulation Algorithm for Chemically Reacting Systems on the Graphics Processing Unit(http://www.cs.ucsb.edu/~cse/Files/GPUSSArevision.pdf)
• PCクラスタ
  • Parallel Stochastic Simulation of Whole-cell Models(http://icsb-2001.org/Posters/110_schwehm2.pdf)
• FPGA
  • Practical Implementation of a Network-based Stochastic Biochemical Simulation System on an FPGA(http://ieeexplore.ieee.org/xpls/abs_all.jsp?arnumber=4630034)
  • The need for speed in stochastic simulation(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/15286647)
  • A Compiled Accelerator for Biological Cell Signaling Simulations(http://portal.acm.org/citation.cfm?id=968280.968313)

ngcom忘年会

みんなすごすぎる...どうしたものか．